| A |
| 1. |  | Aconitum decipiens Worosch. & Anfalov | Борец обманчивый, Аконит изогнутоклювый, Аконит ненайденный, Аконит обманчивый, Борец изогнутоклювый, Борец ненайденный |
| 2. |  | Aconitum paskoi Worosch. | Борец Паско, Аконит Паско |
| 3. |  | Actaea spicata L. | Воронец колосистый, Воронец густоцветковый, Воронец колосовидный |
| 4. |  | Adonis vernalis L. | Адонис весенний, Горицвет весенний, Желтоцвет весенний, Стародубка весенняя |
| 5. |  | Allium altaicum Pall. | Лук алтайский, Лук мелколуковичный |
| 6. |  | Allium altyncolicum N. Friesen | Лук алтынкольский |
| 7. | | Allium tytthocephalum Schult. & Schult. f. | Лук мелкоголовый |
| 8. |  | Aphragmus involucratus (Bunge) O.E. Schulz | Одногнёздка обвёрнутая, Брайя обёрнутая, Одногнёздка обёрнутая |
| 9. |  | Asarum europaeum L. | Копытень европейский |
| 10. |  | Asplenium altajense (Kom.) Grubov | Костенец алтайский |
| 11. |  | Asplenium trichomanes L. | Костенец волосовидный |
| 12. | | Astragalus politovii Krylov | Астрагал Политова |
| 13. |  | Astragalus pseudoaustralis Fisch. & C.A. Mey. | Астрагал ложноюжный |
| 14. |  | Astragalus puberulus Ledeb. | Астрагал пушистый |
| 15. | | Astragalus tschujensis Bunge | Астрагал чуйский |
| B |
| 16. |  | Botrychium multifidum (S.G. Gmel.) Rupr. | Гроздовник многораздельный |
| 17. |  | Brachypodium sylvaticum (Huds.) P. Beauv. | Коротконожка лесная |
| 18. |  | Bupleurum martjanovii Krylov | Володушка Мартьянова |
| C |
| 19. |  | Caragana jubata (Pall.) Poir. | Карагана гривастая, Карагана гривистая |
| 20. |  | Cypripedium calceolus L. | Венерин башмачок настоящий, Башмачок известняковый, Башмачок настоящий, Венерин башмачок жёлтый |
| 21. |  | Cypripedium guttatum Sw. | Венерин башмачок капельный, Башмачок капельный, Башмачок крапчатый, Башмачок пятнистый, Венерин башмачок крапчатый, Венерин башмачок пятнистый |
| 22. |  | Cypripedium macranthon Sw., orth. var. | Венерин башмачок крупноцветковый, Башмачок крупноцветковый, Башмачок крупноцветный, Башмачок Тунберга |
| D |
| 23. |  | Dactylorhiza fuchsii (Druce) Soó | Пальчатокоренник Фукса, Пальцекорник гебридский, Пальцекорник Фукса, Пальчатокоренник гебридский, Пальчатокоренник гибридный, Пальчатокоренник Мейера, Пальчатокорник гебридский, Пальчатокорник Фукса, Ятрышник Фукса |
| 24. |  | Daphne mezereum L. | Волчеягодник обыкновенный, Волчеягодник смертельный, Волчник обыкновенный |
| 25. |  | Delphinium ukokense Serg. | Живокость укокская, Дельфиниум укокский, Шпорник укокский |
| 26. |  | Dendranthema sinuatum (Ledeb.) Tzvelev | Хризантема выемчатолистная, Дендрантема выемчатолистная |
| 27. |  | Dentaria sibirica (O.E. Schulz) N. Busch | Сердечник алтайский, Зубянка сибирская, Сердечник железистый сибирский |
| E |
| 28. |  | Epipactis helleborine (L.) Crantz | Дремлик чемерицевидный, Дремлик густоолиствлённый, Дремлик зимовниковый, Дремлик зимовниковый левантийский, Дремлик лесной, Дремлик морозниковый, Дремлик согуксуйский, Дремлик Тремолса, Дремлик турецкий, Дремлик чемерицевидный левантийский, Дремлик чемерицевидный Тремолса, Дремлик широколистный |
| 29. |  | Epipactis palustris (L.) Crantz | Дремлик болотный, Артрохилиум болотный |
| 30. |  | Epipogium aphyllum Sw. | Надбородник безлистный |
| F |
| 31. |  | Festuca altissima All. | Овсяница высочайшая, Лесовка лесная, Овсяница высокая, Овсяница лесная |
| G |
| 32. |  | Gagea altaica Schischk. & Sumnev. | Гусиный лук алтайский, Гусинолук алтайский |
| 33. |  | Galium paradoxum Maxim. | Подмаренник удивительный, Ложноподмаренник удивительный, Подмаренник необычный |
| 34. |  | Galium triflorum Michx. | Подмаренник трёхцветковый, Подмаренник трёхцветкововидный, Подмаренник японский |
| I |
| 35. |  | Isoetes lacustris L. | Полушник озёрный, Полушник русский, Полушник тончайший, Полушник шиповатый, Полушник щетинистый, Шильник озёрный, Шильник русский, Шильник тончайший, Шильник щетинистый |
| L |
| 36. | | Lepisorus albertii (Regel) Ching | Лепизорус решётчатый, Лепизорус Альберта, Лепизорус линейный, Лепизорус обрешёченный, Леписорус решётчатый, Чешуекучник Альберта, Чешуекучник решётчатый, Щиточешуйник решётчатый |
| N |
| 37. |  | Neottianthe cucullata (L.) Schlechter | Гнездоцветка клобучковая, Гнездовкоцветка клобучковая, Кокушник клобучковый, Неоттианта клобучковая, Неоттианте клобучковая, Понерорхис клобучковый |
| O |
| 38. |  | Orchis militaris L. | Ятрышник шлемоносный, Ятрышник вооружённый, Ятрышник шлемовидный |
| 39. |  | Osmorhiza aristata (Thunb.) Rydb. | Осмориза остистая, Осмориза амурская, Хвостосемянница остистая |
| 40. |  | Oxytropis alpestris Schischk. | Остролодочник нижнеальпийский, Остролодка нижнеальпийская, Остролодочник приальпийский |
| P |
| 41. |  | Platanthera bifolia (L.) Rich. | Любка двулистная |
| 42. | | Potentilla kryloviana Th. Wolf | Лапчатка крыловская, Лапчатка Крылова |
| R |
| 43. |  | Rheum altaicum Losinsk. | Ревень компактный, Ревень алтайский, Ревень густоцветковый, Ревень плотный, Ревень скученный |
| 44. |  | Rhodiola algida (Ledeb.) Fisch. & C.A. Mey. | Родиола морозная |
| 45. |  | Rhodiola coccinea (Royle) Boriss. | Родиола ярко-красная, Очиток ярко-красный |
| 46. |  | Rhodiola krylovii Polozhij & Revjakina | Родиола Крылова, Родиола почти-перистая |
| 47. |  | Rhodiola quadrifida (Pall.) Fisch. & C.A. Mey. | Родиола четырёхраздельная, Родиола четырёхлепестная, Родиола четырёхмерная, Родиола четырёхнадрезанная, Родиола четырёхчленная |
| 48. |  | Rhodiola rosea L. | Родиола розовая, Родиола Кривохижина, Родиола северная |
| S |
| 49. | | Sanicula giraldii H. Wolff | Подлесник Джиральди, Подлесник Жиральда |
| 50. |  | Saussurea glacialis Herder | Соссюрея ледниковая, Горькуша ледниковая |
| 51. |  | Saussurea orgaadayi Khanm. & Krasnob. | Соссюрея оргаадай, Горькуша оргаадай |
| 52. |  | Stemmacantha carthamoides (Willd.) Dittrich | Большеголовник сафлоровидный, Левзея сафлоровидная, Рапонтикум сафлоровидный, Рапонтикум сафлоровый, Стеммаканта сафлоровидная, Форнициум сафлоровидный |
| 53. |  | Subularia aquatica L. | Шилолистник водяной, Шилолистница водяная, Шильник водный, Шильник водяной, Шильница водная |
| T |
| 54. |  | Tulotis fuscescens (L.) Czerep. | Тулотис буреющая, Тулотис буреющий |