| A |
| 1. |  | Adonis parviflora Fisch. ex DC. | Адонис мелкоцветковый, Адонис мелкоцветный, Горицвет мелкоцветковый, Стародубка мелкоцветковая |
| 2. |  | Alyssum desertorum Stapf | Бурачок туркестанский пустынный, Бурачок пустынный |
| 3. |  | Amygdalus bucharica Korsh. | Миндаль бухарский |
| 4. |  | Anemone tschernjaewii Regel, orth. var. | Ветреница Черняева |
| 5. |  | Artemisia tenuisecta Nevski | Полынь тонкорассечённая |
| 6. |  | Astragalus fedtschenkoanus Lipsky | Астрагал Федченко, Астрагал федченковский |
| 7. |  | Astragalus macronyx Bunge | Астрагал длинноноготковый, Астрагал самаркандский |
| 8. |  | Astragalus macrotropis Bunge | Астрагал длиннолодочный |
| 9. |  | Astragalus nucifer Bunge | Астрагал орехоносный |
| 10. |  | Astragalus quisqualis Bunge | Астрагал сомнительный |
| 11. |  | Astragalus sogdianus Bunge | Астрагал согдийский |
| B |
| 12. |  | Bunium persicum (Boiss.) B. Fedtsch. | Буниум персидский |
| C |
| 13. |  | Cerasus verrucosa (Franch.) Nevski | Вишня бородавчатая |
| 14. |  | Chorispora tenella (Pall.) DC. | Хориспора нежная, Дробноплодница нежная, Ломкоплодник нежный, Редечка нежная, Хориспора тоненькая, Чёткоплодник нежный |
| 15. |  | Corydalis ruksansii Lidén | Хохлатка Рукшанса |
| 16. |  | Cousinia outichaschensis Franch. | Кузиния учикашская |
| 17. |  | Cousinia umbrosa Bunge | Кузиния теневая |
| 18. |  | Crambe kotschyana Boiss. | Катран Кочи, Катран котчиевский, Катран Северцова |
| D |
| 19. |  | Dipsacus dipsacoides (Kar. & Kir.) Botsch. | Ворсянка ворсянковидная, Ворсянка лазоревая |
| E |
| 20. |  | Ephedra equisetina Bunge | Хвойник хвощевидный, Хвойник хвощевый, Эфедра горная, Эфедра хвощевая |
| 21. |  | Ephedra intermedia Schrenk & C.A. Mey. | Хвойник средний, Хвойник промежуточный, Эфедра средняя |
| G |
| 22. |  | Gagea ova Stapf | Гусиный лук яйцевидный |
| 23. |  | Gentiana olivieri Griseb. | Горечавка Оливье, Горечавка Оливьера |
| 24. |  | Geranium transversale (Kar. & Kir.) Vved. | Герань поперечная, Герань поперечноклубневая |
| H |
| 25. |  | Heracleum lehmannianum Bunge | Борщевик Лемана, Борщевик Леманна |
| J |
| 26. |  | Juniperus seravschanica Kom. | Можжевельник зарафшанский, Арча зарафшанская, Можжевельник зеравшанский |
| 27. |  | Juno maracandica Vved. | Юнона самаркандская, Ирис самаркандский, Касатик самаркандский |
| L |
| 28. |  | Lonicera altmannii Regel & Schmalh. | Жимолость Альтмана |
| N |
| 29. |  | Neslia apiculata Fisch., C.A. Mey. & Avé-Lall. | Неслия остроконечная, Круглец остроконечный |
| O |
| 30. |  | Oxytropis capusii Franch. | Остролодочник Капю |
| P |
| 31. |  | Phlomoides kaufmanniana (Regel) Adylov, Kamelin & Makhm. | Зопничек Кауфмана, Пустынноколосник Кауфмана, Фломоидес Кауфмана |
| 32. |  | Poa bulbosa L. | Мятлик луковичный |
| 33. |  | Potentilla orientalis Juz. | Лапчатка восточная |
| 34. |  | Potentilla pedata Willd. ex Hornem. | Лапчатка стоповидная, Лапчатка закаспийская |
| R |
| 35. |  | Rosa ecae Aitch. | Шиповник Эйчисон, Роза Э.-К. Эйчисон, Шиповник Эчисона |
| S |
| 36. |  | Stachys betoniciflora Rupr. ex O. Fedtsch. et B. Fedtsch. | Буквица буквицецветная, Буквица олиственная, Чистец буквицецветный |
| T |
| 37. |  | Thalictrum minus L. | Василисник малый, Василистник малый, Василистник холмовой |
| 38. |  | Tragopogon malikus S.A. Nikitin | Козлобородник маликский |
| 39. |  | Tulipa affinis Botschantz. | Тюльпан родственный, Тюльпан сходный |
| 40. |  | Tulipa korolkowii Regel | Тюльпан Королькова, Тюльпан блестящий |
| 41. |  | Tulipa turkestanica (Regel) Regel | Тюльпан туркестанский |
| V |
| 42. |  | Veronica argute-serrata Regel & Schmalh. | Вероника остропильчатая, Вероника Борнмюллера, Вероника каратавская |
| 43. |  | Vicia subvillosa (Ledeb.) Boiss. | Горошек маловолосистый, Вика маловолосистая, Горошек полуволосистый |
| 44. |  | Viola occulta Lehm. | Фиалка скрытая |