Деревня Ларцево расположена в 5 км к северу от левобережного района г. Дубна посреди лесного массива, ограниченного с юго-востока трассой Дубна-Кимры, с запада — Иваньковским водохранилищем, с сверо-востока — трассой Кимры-Ильинское-Горицы, с севера — трассой Ильинское-Тверь.
Лес смешанный. Основные виды деревьев — ель, сосна, осина, береза. В низинах — ольха, ива, черемуха. На возвышенностях, в сосняках — сплошным ковром заросли черники и папоротника орляка.
В километре к северу от деревни — сфагновое клюквенное болото и небольшое торфяное озеро Тпруно.