Речка Учсай протяженностью около 15 км является одним из правых притоков реки Ахангаран и берет свое начало на южном склоне Чаткальского хребта, к северо-востоку от Арашанских озер. Учсай расположен в северной части Ангренского плато, высокогорного плато площадью около 1200 кв. км с полого-волнистым и холмистым рельефом и высотами от 2500-2600 до 3200-3400 м н.у.м. Плато находится у стыка Чаткальского и Кураминского хребтов, на границе Узбекистана и Кыргызстана; здесь берут начало многочисленные истоки рек Ахангаран, Чадак, Касансай, Гавасай. В верховьях Учсая имеется несколько небольших ледниковых озер, крупнейшее из них — озеро Зекиркуль (около 500 х 200 м), возле которого расположена наиболее высокая вершина узбекистанской части Чаткальского хребта — Зекир-бобо (4062 м). На высоте около 2260 м н.у.м. речка Учсай впадает в Урталыксай, который примерно в 3 км ниже по течению сливается с Акташсаем, давая начало реке Ахангаран.