Имеретинское ущелье расположено среди гор Имеретинского горного узла и в частности между массивами Дамхурц и Имеретинским. Ущелье глубокое, крутостенное. По дну его протекает бурная, порожистая и водопадистая река Имеретинка. Перепад высот от самой высокой точки (исток реки Имеретинка на высоте 2530 м) до самой низкой точки (впадение реки Имеретинка в реку Закан на высоте 1350 м) составляет около 1200 метров.
Условно, по составу флоры, ущелье можно поделить на три участка: река Имеретинка в верхнем течении (от истока до Верхнего Имеретинского водопада, где преобладают альпийские луга, каменистые осыпи, нетающие снежники и пр.), в среднем течении (среди субальпийских лугов) и в нижнем течении (протекающая по густому широколиственно-хвойному лесу).