Проточное озеро Арахлей — крупнейшее в системе Ивано-арахлейских озёр (они же Читинские озёра, Беклемишевские озёра, Шакшинские озёра), принадлежит бассейну Енисея. К югу от озера находится Яблоновый хребет — водораздел бассейнов Енисея и Амура. К востоку от Арахлейского оз., отделённое перемычкой, расположено проточное оз. Иван, которое принадлежит бассейну Лены. Участок Яблонового хребта к юго-востоку от оз. Арахлей образует узел, разделяющий водосборные бассейны 3 крупнейших сибирских рек — Амура, Лены и Енисея. Северный берег озера высокий, хорошо дренирован, покрыт лиственничной тайгой, перемежающейся с сельскохозяйственными угодьями — сенокосными и пастбищными лугами, полями, огородами.