| A |
| 1. |  | Abies semenovii B. Fedtsch. | Пихта Семёнова |
| 2. | | Acantholimon compactum Korovin | Акантолимон плотный |
| 3. | | Alajja anomala (Juz.) Ikonn. | Алайя уклоняющаяся, Эриантера уклоняющаяся |
| 4. | | Allium dodecadontum Vved. | Лук двенадцатизубый |
| 5. | | Allium pskemense B. Fedtsch. | Лук пскемский |
| 6. | | Allium semenowii Regel | Лук Семёнова |
| 7. | | Allochrusa gypsophiloides (Regel) Schischk. | Колючелистник качимовидный, Аллохруза качимовидная, Колючелистник гипсофиловидный |
| 8. | | Ammopiptanthus nanus (Popov) S.H. Cheng | Аммопиптант карликовый |
| 9. | | Amygdalus petunnikowii Litv. | Миндаль Петунникова |
| 10. | | Anemone obtusiloba D. Don | Ветреница туполопастная, Ветреница туподольчатая |
| B |
| 11. | | Berberis kaschgarica Rupr. | Барбарис кашгарский |
| 12. | | Bupleurum rosulare Korovin ex Pimenov & Sdobnina | Володушка розеточная |
| C |
| 13. | | Campanula eugeniae Fed. | Колокольчик Евгении |
| 14. | | Centaurea alaica Iljin | Рапонтикоидес алайский, Василёк алайский |
| 15. | | Chesneya villosa (Boriss.) R.Kam. & R.Vinogradova | Чезнейя мохнатая, Чезнея мохнатая |
| 16. | | Cnidiocarpa alaica Pimenov | Книдиокарпа алайская |
| 17. | | Colutea brachyptera Sumn. | Пузырник короткокрылый |
| 18. | | Corydalis pseudoadunca Popov | Хохлатка ложно-согнутая, Хохлатка ложносогнутая |
| 19. | | Crataegus knorringiana Pojark. | Боярышник Кнорринг |
| D |
| 20. | | Delphinium knorringianum B. Fedtsch. | Живокость Кнорринг, Дельфиниум Кнорринг, Живокость Кнорринга, Шпорник Кнорринг |
| 21. | | Dorema microcarpum Korovin | Дорема мелкоплодная, Дорема наманганская |
| E |
| 22. | | Eminium regelii Vved. | Эминиум Леманна, Эминиум Регеля |
| 23. | | Eremurus zenaidae Vved. | Эремурус Зинаиды, Ширяш Зинаиды |
| 24. | | Eremurus zoae Vved. | Эремурус Зои, Ширяш Зои |
| F |
| 25. | | Fritillaria eduardii A. Regel ex Regel | Рябчик Эдуарда, Петилиум Эдуарда |
| 26. | | Fumariola turkestanica Korsh. | Дымяночка туркестанская |
| H |
| 27. | | Hedysarum chaitocarpum Regel et Schmalh. | Копеечник щетиноплодный |
| 28. | | Hyalolaena intermedia Pimenov & Kljuykov | Гиалолена промежуточная |
| I |
| 29. | | Incarvillea olgae Regel | Инкарвиллея Ольги |
| 30. | | Iridodictyum kolpakowskianum (Regel) Rodion. | Иридодиктиум Колпаковского, Ирис Колпаковского, Касатик Колпаковского, Ксифиум Колпаковского |
| 31. | | Iskandera alaica (Korsh.) Botsch. & Vved. | Искандера алайская |
| J |
| 32. | | Juno orchioides (Carriere) Vved. | Юнона орхидная, Ирис орхидный, Касатик орхидный |
| K |
| 33. | | Kaufmannia semenovii (Herder) Regel | Кауфманния Семёнова, Кауфмания короткопыльниковая, Кауфмания Семёнова, Кауфманния короткопыльниковая, Кортуза Семёнова |
| 34. | | Kosopoljanskya hebecarpa Pimenov & Kamelin | Шренкия пушистоплодная, Козополянския пушистоплодная |
| 35. | | Kosopoljanskya turkestanica Korovin | Шренкия туркестанская, Козополянския туркестанская |
| L |
| 36. | | Lamyropappus schakaptaricus (B. Fedtsch.) Knorring & Tamamsch. | Ламиропаппус шакафтарский |
| 37. | | Lepidolopha komarowii C. Winkl. | Лепидолофа Комарова |
| 38. | | Lonicera paradoxa Pojark. | Жимолость странная, Жимолость парадоксальная |
| M |
| 39. | | Malus niedzwetzkyana Dieck | Яблоня Недзвецкого |
| 40. | | Malus sieversii (Ledeb.) M. Roem. | Яблоня Сиверса, Яблоня гиссарская, Яблоня киргизов, Яблоня киргизская, Яблоня Кудряшева, Яблоня неравнолистная, Яблоня персиколистная, Яблоня разнолистная, Яблоня туркменская, Яблоня тянь-шанская, Яблоня Шишкина, Яблоня Юзепчука |
| N |
| 41. | | Nathaliella alaica B. Fedtsch. | Наталиелла алайская |
| O |
| 42. | | Otostegia schennikovii Scharasch. | Отостегия Ольги, Отостегия Никитиной, Отостегия Шенникова |
| P |
| 43. | | Pastinacopsis glacialis Golosk. | Пастернаковник ледниковый |
| 44. | | Physochlaina alaica Korotkova ex Kovalevsk. | Пузырница алайская |
| 45. | | Primula eugeniae Fed. | Первоцвет Евгении, Примула Евгении |
| 46. | | Primula macrocalyx Bunge | Первоцвет крупночашечный, Первоцвет крупночашечковый, Примула вздутая крупночашечная, Примула крупночашечковая, Примула крупночашечная |
| 47. | | Pulsatilla kostyczewii (Korsh.) Juz. | Прострел Костычева |
| 48. | | Pyrethrum leontopodium (C. Winkl.) Tzvelev | Рихтерия эдельвейсовидная, Пиретрум эдельвейсовидный, Пиретрум эдельвейсовый, Поповник эдельвейсовый, Ромашник эдельвейсовый |
| 49. | | Pyrus asiae-mediae (Popov) Maleev | Груша среднеазиатская, Груша Средней Азии |
| 50. | | Pyrus korshinskyi Litv. | Груша Коржинского |
| R |
| 51. | | Rhodiola litwinowii Boriss. | Родиола Литвинова |
| S |
| 52. | | Salvia korolkowii Regel & Schmalh. | Шалфей Королькова, Аришрада Королькова, Шрадерия Королькова |
| 53. | | Salvia vvedenskyi Nikitina | Шалфей Введенского |
| 54. | | Saussurea involucrata (Kar. & Kir.) Sch. Bip. | Соссюрея обёрнутая, Горькуша обёрнутая |
| 55. | | Sclerotiaria pentaceros (Korovin) Korovin | Жестковенечник пятирогий, Щуровския пятирогая |
| 56. | | Scutellaria andrachnoides Vved. | Шлемник андрахновидный |
| 57. | | Scutellaria nepetoides Popov ex Juz. | Шлемник котовниковидный |
| 58. | | Seseli eryngioides (Korovin) Pimenov & V.N.Tikhom. | Жабрица синеголовниковая, Сфенокарпус синеголовниковый |
| 59. | | Seseli korshinskyi (Schischk.) Pimenov | Жабрица Коржинского, Бедренец Коржинского |
| 60. | | Sibiraea tianschanica Pojark. | Сибирка тянь-шанская, Сибирка тяньшанская |
| 61. | | Silene sussamyrica Lazkov | Смолёвка суусамырская |
| 62. | | Sophora pubescens Tausch | Стифнолобиум японский, Софора Королькова, Софора японская, Стифнолобий японский |
| 63. | | Sorbaria olgae Zinserl. | Рябинник Ольги |
| 64. | | Sorbus persica Hedl. | Рябина персидская |
| 65. | | Spiraeanthus schrenkianus (Fisch. & C.A. Mey.) Maxim. | Таволгоцвет Шренка, Спиреантус Шренка, Таволгоцветник Шренка |
| 66. | | Stemmacantha aulieatensis (Iljin) Dittrich | Большеголовник аулиеатинский, Левзея аулиеатинская, Рапонтик аулиеатинский, Рапонтикум аулиеатинский |
| T |
| 67. | | Thesium minkwitzianum B. Fedtsch. | Ленец Минквиц, Ленец Минквица |
| 68. | | Tianschaniella umbellulifera B. Fedtsch. ex Popov | Тяньшаночка зонтиконосная |
| 69. | | Trichanthemis aulieatensis (B. Fedtsch.) Krasch. | Трихантемис аулиеатинский, Волосистоцветочник аулиеатинский, Псевдоглоссантис аулиеатинский |
| 70. | | Trichanthemis aurea Krasch. | Трихантемис золотистый, Волосистоцветочник золотистый |
| 71. | | Tulipa affinis Botschantz. | Тюльпан родственный, Тюльпан сходный |
| 72. | | Tulipa anadroma Botschantz. | Тюльпан вверхстремящийся, Тюльпан анадрома |
| 73. | | Tulipa greigii Regel | Тюльпан Грейга, Тюльпан Краузе |
| 74. | | Tulipa kaufmanniana Regel | Тюльпан Кауфмана, Тюльпан кауфмановский |
| 75. | | Tulipa kolpakowskiana Regel | Тюльпан Колпаковского |
| 76. | | Tulipa korolkowii Regel | Тюльпан Королькова, Тюльпан блестящий |
| 77. | | Tulipa ostrowskiana Regel | Тюльпан Островского |
| 78. | | Tulipa platystemon Vved. | Тюльпан широкотычиночный |
| 79. | | Tulipa rosea Vved. | Тюльпан розовый |
| 80. | | Tulipa tetraphylla Regel | Тюльпан четырёхлистный |
| 81. | | Tulipa zenaidae Vved. | Тюльпан Зинаиды |
| V |
| 82. | | Vitis usunachmatica Vassilcz. | Виноград культурный, Виноград виноносный, Виноград гиссарский, Виноград европейский, Виноград обыкновенный, Виноград узунакматский |
| Z |
| 83. | | Zygophyllum kaschgaricum Boriss. | Парнолистник кашгарский |